Kevés oka van a szoptatás hosszabb időre történő leállításának vagy a szoptatás leállításának. Abban az esetben fertőző betegségek az anya esetében eseti alapon kell eldönteni, hogy ajánlott-e az elválasztás. Ennek oka, hogy a kórokozók átterjedhetnek az anyával tej és kiváltja a megfelelő betegséget a gyermekeknél, a betegség lefolyásának változó súlyosságával.
Emésztőrendszeri (a gyomor-bél traktust érintő) betegségek, mint pl hányás (hányás) és hasmenés (hasmenés) vagy megfázás az anyai betegségek példája, amelyek nem jelzik a szoptatás szünetét vagy akár az elválasztást. Éppen ellenkezőleg, a szoptatás akár meg is védheti a babát a súlyos tanfolyamoktól, mert anyatej számos gyulladásgátló (gyulladáscsökkentő), antimikrobiális és immunmoduláló anyagot tartalmaz.
Anyatej nemcsak kórokozókat tartalmaz, hanem antitestek. Ezek olyan kórokozók ellen irányulnak, amelyekkel az anya nyálkahártyája érintkezésbe került, és amelyek így képesek behatolni az anyai szervezetbe. Általános szabály, hogy a szoptatott gyermekek kevésbé szenvednek ártalmatlan betegségekben, például a hideg. Az anya akkor is folytathatja a szoptatást, ha van láz. Ez azonban annál is fontosabb, hogy biztosítsa a megnövekedett folyadékbevitelt.
A beteg anyának, valamint a többi gondozónak oda kell figyelnie a megfelelőre kézhigiénia annak érdekében, hogy a fertőzésveszély általában alacsony maradjon, különösen a gyomor-bélrendszeri betegségek esetén.
A szoptatás komolyabb esetekben elbátortalanodhat fertőző betegségek mint például a HIV, lásd az alábbi témákat
