A B6-vitamin súlyos hiánya ritka.
Tanulmányok kimutatták, hogy a tiamin szükséges a B6-vitamin megfelelő anyagcseréjéhez és működéséhez. Ezért azoknak az alkoholistáknak a legnagyobb a kockázata, hogy szenvednek a B6-vitamin-hiány következményeitől az alacsony étrendi bevitel miatt.
Egyes tanulmányok dokumentálták a kóros elektroencefalogramokat (EEG) a B6-vitamin hiányában. Egyéb súlyos hiány esetén jelentkező neurológiai tünetek az ingerlékenység, depresszió, és zavartság. Egyéb tünetek közé tartozik a glossitis (a nyelv), sebek vagy fekélyek a száj, valamint rhagádok (repedések és fekélyek) a száj sarkában.